Была создана 11 марта 2003 года, с целью обеспечения контроля за оборотом наркотиков ( выявление, предупреждение, пресечение, раскрытие и предварительное расследование преступлений, отнесённых к подследственности ФСКН РФ)
В апреле 2016 года, были переданы полномочия ФСКН - Министерству внутренних дел Российской Федерации: