В реках, ручьях, озерах, водохранилищах и прудах области обитает свыше 60 видов и разновидностей рыб, относящихся к 15 семействам, из которых наиболее многочисленно семейство карповых (28 видов). Для значительной части видов бассейн Урала является восточным пределом распространения.
Из пяти видов осетровых, обитающих в Урале, только один вид, стерлядь, постоянно обитает в реке. Остальные виды: белуга, русский осетр, шип и севрюга — большую часть жизни проводят в море и в реках встречаются, в основном, во время нерестовых и зимовальных миграций. На среднем плесе Урала сохранились лучшие нерестилища осетровых и места залегания на зиму. К проходным видам, заходящим в Урал из Каспия для нереста, относится белорыбица (семейство лососевых).
В горных ручьях и речках бассейна Сакмары встречаются ручьевая форель и европейский хариус. Кроме того, местообитания ручьевой форели восстановились в некоторых речках и ручьях Абдулинского и Северного районов. В реках и озерах области широко распространена щука, имеющая большое значение для любительского рыболовства, особенно для зимней ловли.
Важнейшими объектами промысла и любительского рыболовства являются лещ, сазан, жерех, язь, подуст, плотва. Повсеместно в озерах и прудах обитает карась. В реках и озерах с глубоководными плесами встречается сом. В области нередко вылавливаются сомы весом в 80-120 кг и более. В реках с каменистым дном обычен налим. Этот единственный у нас представитель тресковых рыб обитает также в глубоководных озерных плесах малых рек бассейнов Илека, Бурли, Уртабурти, которые из-за преобладающего родникового питания даже в самые жаркие летние дни имеют температуру 16-18°С.
Практически все водоемы населяет окунь. Ценным видом промысла и любительского рыболовства на Урале, Сакма-ре, Самаре, Илеке и др. реках является судак. В р.Урал, а чаще всего в бассейне Большого Ика можно встретить каспийскую миногу, которая для икрометания заходит из Каспия в Урал глубокой осенью. Нерестится минога в мае-июне в малых реках с каменистым, галечным и песчаным дном.
В крупнейшем водохранилище области, Ириклинском, обитает 36 видов рыб, в т.ч. такие важнейшие промысловые, как лещ, судак, жерех, сазан, сом. Из вселенных видов рыб большое промысловое значение в Ирикле приобрели сиг и рипус. В прудах области успешно разводятся карп, толстолобик и белый амур.