Естественно, ведь плоскостопие - искривление стопы, которое появляется или врожденно (в ходе каких либо отклонений) или в процессе жизни (авария, по причине которой человек повредил ногу, вследствие чего образовалось плоскостопие), а ведь в аварии можно повредить не только обе ноги, но и лишь одну ногу.
Так что да, плоскостопие может быть на одной ноге, а вторая при этом, оставаться совершенно здоровой.