Череп, в отличие от черепа земноводных, состоит сплошь из костей (только в обонятельной и отчасти слуховой области сохраняется хрящ), число которых очень велико.
Этим череп ящерицы, как и вообще пресмыкающихся, сходен с черепом костистых рыб. Кроме того, для пресмыкающихся крайне характерно наличие крыши из покровных костей, лежащей кнаружи от первичного черепа.