1. Генные, или точковые, мутации — цитологически невидимые изменения в хромосомах.
2. Внутрихромосомные и межхромосомные перестройки: а) перестройки в хромосоме, обусловливающие изменение групп сцепления генов (транслокации) или последовательность их расположения внутри хромосомы (инверсии); б) фрагментация хромосом, приводящая к утрате генов или к их удвоению; этот тип изменений включает нехватки (дефишенси и делеции) и удвоения (дупликации); в) вставки — перемещение участков внутри хромосом (иисерции).
3. Изменение количества хромосом: а) увеличение или уменьшение числа полных гаплоидных наборов хромосом (полиплоидия и гаплоидия); б) изменение количества хромосом в диплоидном наборе (гетероплоидия, или анеуплоидия).