1) экосистемы включают в себя много видов организмов, а в агроэкосистеме преобладает монокультура
2) круговорот веществ в экосистеме замкнутый, а в агроэкосистеме нет, так как часть продукции изымается вместе с урожаем
3) экосистема может существовать без человека, а агроэкосистема нет.