Ответ:
Вы допустили ошибку на строке 7:
for j in range(1, N):
...
Знакомая формулировка задачи, ЕГЭ-27. Вы пошли по пути наименьшего сопротивления, и решили перебрать все возможные пары элементов. Но в таком случае стоит учитывать, что для любого ряда входных данных, если x1 и x2 образуют пару, то эти же числа в обратном порядке учитывать не надо (При вашем переборе программа проверяла и пару x1-x2 и x2-x1, и считала их уникальными, что и приводило к ошибке)
Что бы перебрать все уникальные пары без повторений, вам следует немного изменить параметры вложенного for:
for i in range(N-1):
for j in range(i, N):
....
Таким образом, вы точно так же учтете все возможные комбинации элементов, но сможете избежать повторений.