Скелет полностью окостеневает. Первых два шейных позвонка(атлас и эпистрофей) обеспечивают высокую подвижность головы. Прикрепление поясов конечностей к осевому скелету обеспечило значительную подвижность тела. Массивный костистый череп сочленяется с позвоночником одним мыщелком.
У ящерицы насчитывается 22 пояснично-грудных позвонка, все они несут рёбра, но только первые 5 пар снизу присоединяются к грудине, образуя настоящую грудную клетку. У змей рёбра с грудиной не срастаются вообще, что связано с ползающим образом жизни.