Сходство : все они являются одноклеточными, а значит 1 клетка выполняет все функции, необходимые для данного организма, в клетке имеются общие органоиды : ядро, мембрана, цитоплазма и др.
Различия : есть фотосинтезирующие простейшие ( с хлоропластами) , а есть животного происхождения - гетеротрофы. Есть простейшие - паразиты ( амёба дизентерийная и др) а есть свободноживущие ( инфузория туфелька )
Есть со жгутиками, ресничками, есть с псевдоподиями - т.е. разница в органойдах движения.