В природе молочнокислые бактерии встречаются на поверхности растений (например, на листьях,фруктах овощах, зернах), в молоке, наружных и внутренних эпителиальных покровах человека, животных,птиц,рыб.Таким образом, помимо своей роли в производстве пищи и кормов, молочнокислые бактерии играют важную роль в живой природе, сельском хозяйстве и нормальной жизнедеятельности человека. Влияние ускоренной индустриализации производства молочнокислых бактерий, основанной на небольшом числе адаптированных для заводов штаммов, на природное разнообразие этих бактерий и здоровье человека пока остаётся неизученным.