Большая часть пустыни Намиб – высокие – до 100 и более метров – песчаные дюны, нередко окрашенные в ярко-красный цвет. Это объясняется содержанием зерен гранатов в песке. Движущиеся дюны сглаживают неровности рельефа и преграждают путь временным водотокам. Это - причина необычной изменчивости местности Намиба. В центре пустыни территория камениста или покрыта галечником.
Постоянные реки образуют как бы естественные границы Намибии: на севере Кунене, на юге – Оранжевая. Сезонные реки, из которых самая значительных река Грейт-Фиш – приток Оранжевой, постоянно заносятся дюнами. Неотъемлемая часть ландшафта Намибии – пересыхающие соленые озера. На севере страны, в обширной бессточной впадине на высоте 1065 м, лежит пересыхающее озеро Этоша, площадью 4000 кв. км. В сезон дождей эта впадина заполняется водой и илом, а в сухой период покрывается соляной коркой.
Береговая линии Намибии выровнена и имеет лишь две хорошие естественные гавани – Уолфиш-Бей и Людериц.
На севере и юге Намибии преобладает пустынная растительность. В наиболее приподнятой и лучше увлажненной центральной части страны распространены акациевые сообщества. На востоке, вдоль границ с Калахари, простирается опустыненная саванна. Большая часть пустыни Намиб вообще не имеет растительного покрова. Многие растения на побережье приспособились к усвоению влаги туманов.