Размножается плаун двумя способами – спорами и вегетативно. Споры образуются в специальных «мешочках» - спорангиях, расположенных на узких, цилиндрических листочках, растущих вертикально вверх. Колоски, в которых расположены спорангии, образуются лишь при определенных, благоприятных для растения условиях. Срок жизни растения некоторых видов плауна (например, плауна булавовидного) может достигать 40-50 лет, при этом образование спор начинается через 20-30 лет после прорастания.