Одна из причин, почему Атакама не получает достаточное количество осадков, состоит в явлении, называемом дождевая тень (rain shadow – территория наименьшего выпадения осадков). Теплый, влажный тропический воздух, который дует с востока и приносит осадки для джунглей Южной Америки, встречает препятствие на восточных склонах Анд. Горы настолько высокие, что потоки воздуха охлаждаются, конденсируются и там выпадают дожди (или снег). Это одна из причин, почему бассейн Амазонки и сама река является самой крупной в мире. Горы, которые способствуют тому, что Амазонка является самой крупной рекой благодаря выпадению здесь обильных осадков, являются причиной того, что в пустыне Атакама не выпадают вообще никакие дожди. Самое сухое и самое влажное места в мире расположены в непосредственной близости друг к другу!
К первой причине добавляется и вторая. Пустыня Атакама располагается в непосредственной близости от Тихого океана, в котором холодное течение Гумбольдта направляется от Антарктиды на север и проходит вдоль западного побережья Чили и Перу. Поэтому температура воды Тихого океана у побережья существенно ниже, чем можно было бы ожидать на этой широте. Любой ветер с моря охлаждается, когда он пересекает течение Гумбольдта, и ему не хватает достаточного количества тепла, чтобы подобрать влагу с поверхности океана. Таким образом, в отличии от большинства ветров с морей и океанов, эти являются сухими.