Возвышенность Кучилья-Гранде образует водораздел между короткими реками, впадающими в Атлантический океан и более длинными реками, текущими на запад и впадающими в реку Уругвай. На востоке реки впадают в лагунное озеро Мирим, частью принадлежащее Бразилии. Основная судоходная река - Уругвай, длиной 1650 км, по ней проходит граница Уругвая с Аргентиной. Главный приток Уругвая – Рио Негро.