Инбридинг - близкородственные скрещивания. Поскольку часто бывают аномалии, в селекции с целью сохранения полезных аллелей используют инбридинг умеренной степени. Инбридинг высокой степени служит генетическим обоснованием нежелательности близкородственных браков у людей. Инбридинг используется для выявления рецессивных аллелей, получения "чистых линий", для сохранения в популяциях различных признаков.
Аутбридинг - система скрещивания неродственных форм одного вида. Аутбридинг используют для повышения или сохранения определённой степени гетерозиготности особей. Это имеет большое значение в селекции с/х животных и растений. Гетерозис - это превосходство гибридов по ряду признаков над родительскими особями. Это характерно для гибридов первого поколения, а затем его эффект ослабляется и исчезает. Вот и получается, что в первом поколении гены в доминантном состоянии, а затем "теряют силу". Гетерозис нередко приводит к повышению урожайности и продуктивности, но использование его часто не эффективно, т. к. не решена проблема закрепления гетерозиса в дальнейших поколениях.