У глагола прилетели - окончание "и".У глаголов не всегда бывает по 2-3 буквы в окончании. Для разбора подобных глаголов, необходимо разобрать всё слово. Тоесть: определить корень (подобрать однокоренные слова), приставку (если есть,всегда идёт перед корнем), суффикс (всегда идёт после корня). Оставшаяся часть слова и будет окончанием.