Существуют две точки зрения на происхождение котловин озер Эльтон и Баскунчак.
Первая из них: озера остаточного происхождения, образовались на месте моря, которое здесь было свыше 100 тыс. лет назад
Вторая: озера провального происхождения, образовались при обрушении соляного купола.