Современные пресмыкающиеся произошли от древних амфибий-стегоцефалов, живших около 350-400 млн лет назад.
Наиболее древними из пресмыкающихся считают котилозавров,существовавших 230-250 млн лет назад. Некоторые черты их организации сохранились у черепах.
Веком расцвета пресмыкающихся был период от 250-65 млн лет назад.