В политической сфере сепаратизм способен привести к следующим негативным последствиям:
— общей дестабилизации ситуации в стране;
— ослаблению государственного суверенитета и выходу отдельных территорий из-под контроля федеральных властей;
— появлению организаций, выступающих под лозунгами сепаратизма и обладающих значительным политическим влиянием;
— подрыву авторитета федеральной власти среди населения страны;— возникновению проблемы беженцев, которая может иметь серьезные политические и социально-экономические последствия.
В военной сфере сепаратизм может привести к возникновению ряда деструктивных процессов:
— нарушению военной инфраструктуры страны;
— установлению экстремистскими группами контроля над территорией, занимаемой военными объектами;
— созданию в районах действия сепаратистских движений баз террористов, а также появлению новых каналов проникновения на территорию России оружия, взрывчатых материалов и наркотиков;
— превращению отдельных районов страны в очаги военного противостояния федеральным силам.
Сепаратизм способен подорвать экономический потенциал страны в результате дезорганизации хозяйственной жизни не только на региональном, но и на федеральном уровнях.
В духовной сфере сепаратизм ведет к распространению националистических идей, которые способствуют радикализации сознания и политического поведения населения страны.