Основным является гибридологический метод — система скрещиваний, позволяющая проследить закономерности наследования признаков в ряду поколений.
Скрещивание, при котором анализируется наследование одной пары альтернативных признаков, называетсямоногибридным, двух пар — дигибридным, нескольких пар — полигибридным. Генеалогический — составление и анализ родословных;цитогенетический — изучение хромосом; близнецовый — изучение близнецов; популяционно-статистический метод — изучение генетической структуры популяций