1. Подцарство миксомицетов (низшие грибы) ( Myxobionta ). Вегетативная фаза состоит из плазмодия (многоядерной подвижной протоплазматической массы, лишённой клеточных стенок) или псевдоплазмодия (агрегата голых одноядерных амёбоидных клеток, сохраняющих свою индивидуальность) . Питание как голозойное, так и абсорбтивное . Жгутиконосные клетки, когда они имеются, обычно несут два неодинаковых жгутика. Споры и спорангии (вместилища спор) обычно многочисленные. Включает один отдел (тип) слизистые грибы, или миксомицеты ( Мухомусо ta ).
2. Подцарство грибов (высшие грибы) ( Mycobionta ). Плазмодий или псевдоплазмодий отсутствует. Вегетативная фаза состоит из нитей (гиф) или клеток с ясно выраженной клеточной стенкой. Питание только абсорбтивное . Жгутиконосные клетки, когда они имеются, с одним или двумя жгутиками. Включает отделы: мастигомицеты, или зооспоровые грибы ( Mastigomycota ), зигомицеты ( Zygomycota ), аскомицеты ( Ascomycota ) и базидиомицеты ( Basidiomycota ), а также искусственный отдел несовершенные грибы ( Deuteromycota