При нагревании тела его внутренняя энергия увеличивается, а, следовательно, увеличивается и кинетическая энергия движения его молекул и потенциальная энергия их взаимодействия, то есть скорость хаотического движения молекул и расстояние между ними увеличиваются.
Одну молекулу какого-либо тела просто так нельзя взять и нагреть, оставив остальные без внимания. Но существуют такие приборы, как, например, коллайдеры, в которых частицам сообщают большую кинетическую энергию, отчего они нагреваются.