Аргуни (за начало принята восточная оконечность острова Безумный), впадает через Амурский лиман и Сахалинский залив в Охотское море. За устье принят створ мысов Озерпах и Пронге. Длина 2824 км, а от истока Аргуни (Хайлар) 4440 км. Гидрографическая сеть Амура включает 10 610 рек (из них 1684 реки длиной менее 10 км) и 61426 озёр, с площадью зеркала 10 599 км2 (включая бессточные Торрейские озёра).
Долина Амура— в основном продукт эрозионных процессов, общее направление которых было обусловлено тектоникой. По особенностям строения речной долины выделяются 3 основных участка. Верхний Амур (длина около 900 км) — от истока до г. Благовещенска (устье р. Зеи) — носит преимущественно горный характер. До впадения притока Амуэрхэ долина в плане чёткообразная: чередуются относительно небольшие котловины и разделяющие их сужения. Склоны долины скалистые, высокие; значительная скорость течения. Справа к реке подходят отроги Большого Хингана.
Ниже Амур течёт между Амурско-Зейским плато и хребтом Ильхури-Алинь. Долина реки расширяется, появляются развитые меандры, например Корсаковские кривуны, длиной 45 км и шириной перешейка меандра всего 0,6 км. Участок от г. Благовещенска (устье реки Зеи) до г. Хабаровска, протяжением около 1000 км, называют средним Амур .Здесь река вначале течёт вдоль пониженного края Зейско-Буреинской равнины, затем прорезает хребет Малый Хинган и выходит на Среднеамурскую низменность. На этом участке Амур приобретает черты равнинной реки — широкая долина, русло с низменными и местами заболоченными берегами, многочисленные осередки и острова. Образуемые ими протоки называют «разбоями». Скорость течения реки уменьшается. Лишь ниже устья р. Бурей, где Амур на протяжении 150 км пересекает Малый Хинган, река течёт в живописном каньоне, одним руслом, образуя мощный поток.
В пределах среднего Амур река получает основное питание. Здесь впадают все главные притоки Амур: слева — Зея и Бурея, справа — Сунгари и Уссури.
От г. Хабаровска начинается нижний Амур .Река имеет широкую долину и течёт по Нижнеамурской низменности. Русло дробится на рукава, широкая пойма изобилует множеством озёр; площади зеркала крупнейших озёр (Болонь, Удыль, Орель, Б. Кизи и др.) до нескольких десятков км2, соединены с Амуром протоками. Здесь река принимает только один значительный приток (левый) — р. Амгунь, впадающий у самого устья. Ниже г. Николаевска-на-Амуре начинается мелководный Амурский лиман, тянущийся на 48 км.