В клетках водорослей имеется ядро, хлоропласты, вакуоль, митохондрии, в бактериальной клетке нет этих органоидов. В клетках бактерий есть рибосомы, в клетках водорослей их нет. Клеточная стенка водорослей состоит из целлюлозы, у бактерий - из муреина.