Происходит процесс передачи тепла (энергии) горения спиртовки через стенки сосуда, жидкости. Внутри самой жидкости возникает конвекция. Это явление, когда тёплые слои жидкости поднимаются вверх, а холодные опускаются вниз. Таким образом жидкость достаточно равномерно нагревается.
Температура является макроскопическим показателем внутренней энергии тела.
При горении, происходит химическая реакция (разрыв и создание новых связей), в результате которой молекулы, участвующий в гарении приобретают большую кинетическую энергию, которую, ударяюсь о сосуд передают молекулам пробирки, а те уже передают её молекулам воды.
Энергия также передаётся в виде излучения. Свет, который вы видите (и не видите) при горении, явлется по сути переносчиком энегии. Фотоны, выдилившиеся при переходах электронов в атомах между энергетическими уровнями, также поглащаются молекулами стекла и воды.