Высшие иерархи церкви считали, что их власть должна быть выше царской. Цари - же почему - то так не считали. Поэтому Алексей Михайлович загнал Никона в дальний монастырь, а его сынок, Пётр I вооще разогнал патриаршество, заменив его государственным органом - священным синодом.