Я изучал скрипты на курсах, в 5 классе, но вроде бы так:
n1=prompt("Введите первое число","")
n2=prompt("Введите второе число","")
sum = parseInt(n1) + parseInt(n2); // Или ParselFloat(n1)+ParselFloat(n2)
alert("Сумма чисел равна "+S);
Или можно через переменные, но у вас как я понял должен быть запрос на числа...