На Галапагосских островах он обнаружил несколько видов вьюрков, у которых клюв был различных размеров, после этого он задумался об изменчивости и неверности креационизма.
Изучая скелеты древних животных в геологических отложениях Ю. Африки, Дарвин нашел сходство между вымершимими видами животных с современными броненосцами и ленивцами.
Так же Дарвин вновь столкнулся с аналогичной проблемой, животные, обитавшие у берегов Зеленого Мыса, имели сходства с материковыми видами, хоть и отличались некоторыми существенными чертами.
Эти наблюдения Дарвин не мог объяснить с позиции креационизма.