Клубень - видоизмененный укороченный ПОБЕГ растения
Луковица - так же видоизмененный ПОДЗЕМНЫЙ побег растения
Корневище - также видоизмененный ( чаще всего подземный) Побег.
В общем общий признак - клубень, луковица,корневище, это все видоизмененные подземные побеги.
А различие в внешнем строении этих подземных побегов и соответственно их функциями.