Научные заслуги. Общая длина его рабочих маршрутов по Центральной Азии превышает 31,5 тысячи километров.
В корне изменил представление о рельефе и гидрографической сети Центральной Азии. Он положил начало исследованиям ее климата и много уделял внимания изучению флоры: более 200 видов и семь родов неизвестных ботаникам.
Огромный вклад Пржевальский внес и в изучение центрально-азиатской фауны, собрав коллекции позвоночных— около 7,6тысячи экземпляров, среди них несколько десятков новых видов.