В первую очередь, название этих типов логически указывает нам на морфологические различия: круглые черви в поперечном сечении тела круглые, плоские - имеют уплощенное тело. У круглых червей имеется первичная полость тела, заполненная жидкостью (схизоцель), которая отсутствует у плоских. Круглые черви имеют сквозную пищеварительную систему (потребление пищи через рот, выделение - через анальное отверстие), тогда как плоские - слепозамкнутую (потребление и выделение через ротовое отверстие). В основном, плоские черви обладают гермафродитизмом, тогда как круглые - раздельнополые.