главное различие это расположение спорангиев в пазухе листа или на его внутренней поверхности и очень мелкие споры без воздушных мешков.
анатамическое строение их вегетативного тела , его морфология, в частности преобладающий тип ветвления (Равно или неравнодихотомический)
способ размножения и оплодотворение сперматозоидами , снабженными жгутиками ризоиды появляющиеся на опрделенной стадиии развитиия