Какие файлы обычно хранятся на серверах файловых архивов?
Да, вроде, разные... Если имеются в виду хостинги, то шифровать файлы нерационально, они так и хранятся, а если, например, сервер с оцифрованными курсовыми соседнего ВУЗа, то там будут картинки (ибо сканы)