В своем опыте Миллер использовал газовую смесь, состоящую из аммиака, метана, водорода и водяного пара (по предположению Миллера, именно эта смесь преобладала в первичной атмосфере Земли).
Так как эти газы не могли вступить в реакцию в естественных условиях, он подвергал их воздействию электрической энергии, имитируя грозовые разряды в атмосфере. Эта смесь кипятилась,подвергаясь воздействию электрических разрядов.
Проведенный анализ показал, что из двадцати аминокислот, составляющих основу любого белка, образовались только три,при чем молекулы были “неживыми”.
Позднее учеными было доказано,что первичная атмосфера состояла из двуокиси углерода и азота, а не из водорода, метана и аммиака. При взаимодействии двуокиси углерода и азота органические вещества не образуются или образуются в небольшом количестве.А свободный кислород,котрый бы находился в первичной атмосфере,вообще бы разрушил органические соединения.
То есть Миллер специально выбрал для себя нужные газы, которые бы подходили для синтеза аминокислот, но вовсе не те, что были в первобытной атмосфере.
Через несколько лет молчания Миллер сам признал, что среда, которую он использовал в своем опыте, была не настоящей.
Эксперимент Миллера был лишь искусственной,контролируемой лабораторной работой, направленной на синтез аминокислот. Виды и количество использованных газов были подобраны в самой идеальной для образования аминокислоты пропорции. То же самое касается и количества энергии, использованной для получения желаемой химической реакции.