Василия стали называть Косым, после того , как его ослепили, когда он был в плену у Василия Васильевича, за неблаговидный поступок его сторонников по отношению к пленённому ими князю, стороннику Василия Васильевича.
Шемяка - прозвище, по русской версии от слова шеемяка, т.е. способный намять шею, силач, а по татарской - от слова чимэк - украшение,наряд.