Озера:
Онежское и Ладожское (около Санкт-Петербурга)
Чудское (недалеко от Пскова, на границе с Эстонией)
Баскунчак и Эльтон (недалеко от Каспийского моря, на границе с Казахстаном)
Чаны (Барабинская низменность)
Таймыр (п-ов Таймыр)
Байкал (около Иркутска и Улан-Удэ)
Ханка (на границе Приморского края России и провинции Хэйлунцзян Китая)
Реки:
Волга (Восточно-европейская равнина)
Кубань (около Новороссийска)
Кама и Ока (притоки Волги)
Северная Двина (в её устье стоит Архангельск)
Печора (почти у Уральских гор, также рядом Тиманский кряж)
Обь с Иртышом (сразу за Уральскими горами)
Енисей (на границе Западно-сибирской равнины и Среднесибирского плоскогорья)
Ангара (вытекает из Байкала)
Хатанга (рядом с одноименным городом)
Оленёк (рядом с Анабарским плато, впадает в море Лаптевых)
Лена и её приток Вилюй (чуть дальше на Восток, чем Оленёк)
Яна (от Лены её отделяет Верхоянский хребет)
Индигирка и Колыма (их разделяет Колымская низменность)
Шилка и Аргунь и образующийся ими Амур (граница с Китаем)
Это самые известные, перечислить вообще ВСЕ, я думаю, невозможно.