В начале 19 века А. Г. Бахерахт в России заложил основы военной и морской гигиены.Глубокий анализ причин высокой заболеваемости и смертности, проблем охраны народного здоровья дали в своих трудах М. В. Ломоносов и С. Г. Зыбелин. Была установлена зависимость здоровья различных групп населения от условий труда и быта.Крупнейшее открытие 19 века — разработка клеточной теории строения организмов . К. Бернар в середине 19 века работал над созданием экспериментальной М., объединяющей физиологию, патологию и терапию. Многими исследованиями действия лекарств, веществ и ядов на организм К. Бернар заложил основы экспериментальной фармакологии и токсикологии.Крупнейший русский клиницист 2-й половине 19 века С. П. Боткин стремился к тому, чтобы методы исследования, наблюдения и лечения больного строились на естественнонаучной основе. В 70-х годах 19 века он установил, что изменения функции сердца часто непропорциональны анатомическим изменениям, и пришёл к выводу об их зависимости от центральных нервных аппаратов, а через них — от условий окружающей среды. В середине, и особенно во 2-й половине 19 века, от терапии отпочковываются новые отрасли, например, педиатрия, существовавшая и прежде как отрасль практического врачевания, оформляется в качестве научной дисциплины, представленной кафедрами, клиниками.Успехи микробиологии были столь очевидны, что 2-я половина 19 века вошла в историю М. как «бактериологическая эра», открывшая роль микроорганизмов в патологии человека.