Три причины:
1. Для защиты препарата от неосторожных движений микроскопа.
2. Для предохранения от пыли
3. Для сжатия препарата. Например, жидкость растягивается этим стеклом в капиллярно-ноткий слой БЕЗ свободной поверхности, что позволяет удобно рассматривать микроорганизмы практически в одном слое. А НЕжидкие объекты этим стеклом просто приводятся более или менее в плоскую форму, что облегчает фокусировку микроскопа.