Агротехника
а - окончание;
агр - первый корень;
техн - второй корень;
ик - суффикс;
агротехник - основа;
о - соединительная гласная.
Агроиндустрия
я - окончание;
агр - первый корень;
индустри - второй корень;
агроиндустри - основа;
о - соединительная гласная.
Соединительная гласная в основу слова не входит!