Подавляющее большинство плоских червей — гермафродиты. Размножаются плоские черви преимущественно половым путем, хотя отдельные представители сохранили способность к бесполому размножению.В многочисленных семенниках образуются сперматозоиды, которые по семяпроводам попадают в семенные мешки и там хранятся в виде спермы. Яичники располагаются по бокам тела в паренхиме. Из них яйцеклетки по яйцеводам попадают в семяприемник, где и происходит оплодотворение. Оплодотворению предшествует копуляция.Бесполое размножение осуществляется путем поперечного деления планарии (Класс Турбеллярии) пополам. Затем каждая половина регенерирует недостающие части тела.