Теория Дарвина была только началом теории эволюции. Дарвин просто заметил плавные переходы между видами, объяснил "одинаковость" существ внутри вида наследственностью, а видовую изменчивость назвал эволюцией и объяснил естественным отбором. Современная теория (синтетическая теория эволюции) вносит свои поправки (а именно объясняет эволюцию не только естественным отбором, но и с помощью генетики) , но суть та же. Современные обезьяны и люди произошли от общего предка (назовем ее праобезьяной) .
А доказательств предостаточно - постоянно находят ископаемые виды, которые давно вымерли, но существовали, и являлись промежуточными видами между чем-то и чем-то, например, между "праобезьяной" и человеком, или между "праобезьяной" шимпанзе.