Во-первых, жесткие диски используются для хранения гораздо больших объемов информации. там хранится практически все, что вы можете найти на своем компьютере. гибкие диски предназначены для хранения и передачи информации.
во-вторых, жесткие диски позже гибких появились, тут уже вопрос развития техники)