Отбирать темных голубей, остальных употреблять в пищу. Когда появятся черные голуби, изолировать их по парам и следить за потомством. Если все потомство черное, то имеем чистых представителей признака. Если нет, то хотя-бы один из родителей - не чист. Можно пробовать формировать из нечистых пар новые пары, постепенно избавляясь от "нечистых"
При достижении достаточного количества "чистых", дальнейшая работа по скрещиванию идет на улучшение других характеристик - болезнеустойчивость, красивость и т. п. Но от потомства двух голубей особых улучшений ждать не приходится.