У некоторых растений могут появляться видоизмененный корни вследствие обретения новых функций. Это корнеплоды, корневые клубни, корни-зацепки, ходульные корни, воздушные корни, микориза, бактериальные клубеньки на корнях высших растений.
У некоторых двулетних растений (репы, петрушки, моркови) корень преобразуется в корнеплод, который представляет собой утолщенный придаточный корень. В формировании корнеплода принимают участие главный корень и нижний участок стебля. В структуре корнеплода главное место принадлежит запасающей основной ткани