Прекрасный проверяем букву А красный т.е. красивый.
Пре- приставка, Е на её конце пишется лишь в тех случаях когда сходно со значением слова очень или когда сходно со значением приставки пере-.
На этот счет существует правило:
Если приставка обозначает присоединение, приближение, неполное действие, то в ней пишется буква и (это приставка при-)
Если приставка близка по значению к слову очень или к приставке пере- то пишется буква е (это приставка пре-)