Из-за понижения температуры внутри бутылки скорость движения молекул воздуха в среднем уменьшилось, поэтому давление упало. А внешнее давление осталось прежним, поэтому давление стремясь выровняться уменьшает объем внутри бутылки, чтобы давление опять стало близким к атмосферному.