1)Это можно объяснить тем, что все организмы произошли от одного общего предка, а также тут зависимость от того в каких условиях обитали те или иные организмы, если условия остались прежними, то будет много сходств, например кистеперые рыбы почти не отличаются от своих предков, хотя прошла уже очень много времени
2)Также все зависит от условий среды, если раньше на том месте где нашли окаменелости была зима, а сейчас тепло, то следовательно, например, густой шерстный покров не нужен организмам, как он нужен был предкам.