Каждый нефрон начинается микроскопической двустенной капсулой, имеющей форму чаши и называемой капсулой Боумена-Шумлянского. Между эпителиальными стенками чашечки находится узкая полость, переходящая в просвет извитого канальца первого порядка. К каждой чашечке подходит приносящая артериола, которая в её углублении распадается на капиллярную сеть, называемую сосудистым клубочком, по ней кровь идёт к нефрону.
Сосудистый клубочек работает как фильтр. Благодаря большому давлению крови через стенки его капилляров в полость чашечек поступает часть плазмы крови.При этом все соли, глюкоза, аминокислоты и другие вещества с низкой молекулярной массой, содержащиеся в плазме, свободно переходят в клубочковый фильтрат, называемый первичной мочой (150-180 л). Далее она продвигается по почечным канальцам. Клетки крови и белки плазмы, имеющие размеры, превышающие диаметр пор фильтра, остаются в крови и выходят из капсулы через выносящую артериолу.