1)Р. п. Окончания будут разные, потому что слова относятся к разным склонениям.
2)Окончание необходимо писать исходя из падежа и склонения имени существительного. Давно облетели осенние листья клёна,липы,тополя,берёзкИ ( 1 скл., р.п. ) . Повест., невоскл., простое. двусост., распр., осложнено однород. дополнениями. Основа : облетели листья = -. Обстоят. : давно -.-.- Определение : осенние ~ Дополнение : клена, липы, тополя, березки -----Только иглы елИ ( 3 скл., р.п. ) .,кедра,,пихты остались зелёными ..