Крепостная стена на флаге - символ Екатеринодарской крепости. Желтый вензель Екатерины 2 на фоне стены, что город назван Екатеринодаром в ее честь.
Составляющие цвета флага:
Желтый цвет - цвет богатства, символ постоянства, знатности, веры.
Белый цвет - цвет чистоты, благородства, практичности.
Красный цвет - символ любви, мужества
Черный цвет - символ мудрости, осторожности